한국영토서원은 우리의 고토(古土)인 독도를 수호하고, 우리의 가슴속에서 점점 잊혀져 가고 있는 땅 간도와 대마도 그리고 연해주 등 고토를 지금 당장 우리가 되찾을 수 없더라도 이들 땅이 엄연한 우리의 땅이었다는 사실을 분명하게 후 세대에게 알리고, 이 시대를 살아가는 주인공으로서 이들 땅이 우리의 영토임을 천명하며, 언젠가 후세대가 되찾을 수 있도록 그 근거를 전해줄 목적으로 2018년 12월 18일 설립된 비영리법인이다. 이러한 설립목적을 달성하기 위해 한국영토서원은 대한민국 고토에 대한 각종 자료를 수집ㆍ분석ㆍ관리하며, 이를 토대로 고토에 대한 교육ㆍ연구ㆍ홍보 등을 통해 고토에 대한 국민적 인식과 영유권에 대한 공감대를 형성함으로써 고토수호와 고토 회복에 필요한 전문가를 양성ㆍ지원하기 위해 노력하고 있다.